غارهای استان یزد با وجود قرار گرفتن در منطقه‌ای کویری، بخشی ارزشمند از میراث طبیعی این استان به شمار می‌روند و علاوه بر برخورداری از ساختارهای زمین‌شناختی کم‌نظیر، زیستگاه گونه‌های جانوری و گیاهی و بخشی از تنوع زیستی مناطق کوهستانی هستند.